שחזור הודעות ווטסאפ שנמחקו אפשרי במקרים מסוימים, כאשר המחיקה נעשתה לפני פחות משבעה ימים — ווטסאפ שומרת גיבוי יומי אוטומטי בענן (Google Drive או iCloud), ולכן ניתן להסיר את האפליקציה ולהתקינה מחדש כדי לשחזר מהגיבוי האחרון. עם זאת, אם עברו יותר משבעה ימים מאז המחיקה, הסיכויים יורדים משמעותית, שכן הגיבויים החדשים כבר אינם כוללים את השיחה המחוקה. ניתן גם לבדוק קבצי גיבוי מקומיים במכשיר עצמו, אך גם שם החלון לשחזור מוגבל בזמן.